Od 1987. godine zaposlen je u Prirodnjačkom muzeju u Beogradu, gde obavlja poslove kustosa. Stekao je i najviše stručno zvanje, muzejski savetnik. Tokom rada u muzeju posvetio se botaničkim istraživanjima balkanskih zemalja, u okviru aktivnosti muzeja, kao i u više naučnih projekata.

Sakupio je preko 40 000 eksikata za herbarijum muzeja, od čega oko 400 nalaza pripada novim taksonima za ovu zbirku. Takođe je pronašao 160 vrsta i podvrsta nepoznatih za floru Srbije i okolnih zemalja. Autor je ili saradnik na dvadesetak muzejskih izložbi, od kojih je posebno značajna „Drvo ili život sam” održana u Galeriji SANU 2012. godine.

Na Univerzitetima u Beogradu i Novom Sadu bio je mentor za tri i član komisije za 11 doktorskih disertacija.

Dosadašnji istraživački rad dr Marjana Niketića pretežno se odvijao u oblastima fitotaksonomije, floristike i fitogeografije. Bibliografski opus obuhvata 147 publikovanih naučnih radova, 3 monografije i 50 poglavlja u monografijama. Niketić je, između ostalog, samostalno ili u saradnji sa drugim autorima, validno opisao i publikovao osam novih vrsta i jedan hibrid za nauku, dok je još četiri nove vrste preliminarno objavio.

Pored ovih istraživanja, M. Niketić se bavio i problematikom zaštite prirodnih dobara, studijama biotičkih odnosa biljaka i fitopatogena, hemotaksonomskim, kariološkim, filogeografskim, molekularnim analizama, itd. Posebnu pažnju posvetio je i integraciji bioloških podataka u informacione sisteme. Njegova aplikacija za procenu stepena ugroženosti taksona u službenoj je upotrebi za konzervacione projekte na republičkom nivou.

Čestitamo dragom kolegi i želimo nove uspehe u daljem radu!